האקדמיה הוקמה מתוך :

1. רצון לקדם ולפתח בישראל את ענף בריאות הציבור במישור המנהלי, המדעי, הקליני, החברתי, ההוראתי והאתי, בתאום עם הר"י ובשיתוף עמה.

2. לדאוג לחינוך דור צעיר של רופאים מתמחים בבריאות הציבור ושל רופאים אשר עניינם ועיסוקם בבריאות הציבור ובמישורים הקרובים לה.

3. לקדם את המחקר המדעי בתחום בריאות הציבור ואת הפצת המידע המחקרי בקרב עמיתים, מקבלי החלטות והציבור הרחב.